fallback-image

GermOnline 4.0 es un portal genómico para el desarrollo de la línea germinal, la meiosis y el ciclo celular mitótico.

GermOnline 4.0 es un portal de bases de datos entre especies que se centra en datos de expresión de alto rendimiento relevantes para el desarrollo de la línea germinal, el ciclo celular meiótico y la mitosis en células sanas en comparación con las malignas. Se trata, por tanto, de una fuente de información para los científicos de la vida y los médicos interesados en la expresión génica y las redes de regulación. El portal GermOnline proporciona acceso ilimitado a la información generada por microarrays de oligonucleótidos de alta densidad (3′-UTR GeneChips), a la prueba de unión proteína-ADN en todo el genoma y al estudio de las interacciones proteína-proteína en el contexto de la explicación del genoma Ensembl.

MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit
Bioingentech
MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit
Bioingentech
MULTIPLEX KIT PCR Babesia & Theileria PCR kit
Bioingentech
MULTIPLEX KIT PCR Babesia & Theileria PCR kit
Bioingentech
ranavirus PCR kit
Bioingentech

La muestra utilizada para producir datos de expresión de alto rendimiento y para realizar la prueba de unión al ADN in vivo en todo el genoma descrita por el Sistema de Gestión y Anotación de Información Multiómica (Mimas 3.0) que cumple con MIAME. Además, se desarrolló e integró en la pasarela Saccharomyces Genomics Viewer (SGV). SGV es una herramienta de visualización que da salida a los datos de expresión específicos y del genoma de la cadena de ADN producidos por microarrays de oligonucleótidos de alta densidad (Sc_tlg GeneChips) que cubren el genoma completo de las levaduras en ambas cadenas de ADN. Esto facilita la interpretación de los niveles de expresión y las estructuras de los transcritos se determinan para diferentes tipos de células fueron cultivadas en el crecimiento y la diferenciación en diferentes condiciones.

Paraffin Wax Dispenser
Scientific Laboratory Supplies
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences
MagSi-WAX
AMSBIO
MagSi-WAX
AMSBIO

La mayoría de las revistas científicas que publican experimentos de microarrays exigen cumplir las normas de Información Mínima sobre Experimentos de Microarrays (MIAME). Garantizar que otros investigadores tengan la información necesaria para interpretar los resultados o reproducirlos. MIAME la información necesaria incluyendo los datos crudos experimentales, los datos procesados y los procedimientos de procesamiento de datos.

Sin embargo, el método de normalización a menudo se comunica de forma inexacta o no se comunica en absoluto. Tal vez ni siquiera se conozca el factor de escala, excepto para los usuarios experimentados de la normalización de software. Proponemos que, mediante un algoritmo de agrupación de semillas, los investigadores puedan identificar o verificar la información de normalización que hasta ahora se desconocía o estaba en duda. Para ello, producimos estadísticas descriptivas (media, varianza, cuantiles y momentos) para los datos de expresión normalizados de los experimentos de chips de genes disponibles en la base de datos de chips ArrayExpress y clusters basados en estas estadísticas.

Protein A protein
Fitzgerald
pLDH Protein Protein
Abbexa
pLDH Protein Protein
Abbexa

Para verificar la agrupación de chips con el método de normalización, normalizamos los datos brutos a los chips seleccionados de un experimento en ArrayExpress utilizando varios métodos. A continuación, producimos las mismas estadísticas descriptivas para los datos se normaliza y el chip de clúster utilizando estas estadísticas. Utilizamos este conjunto de datos conocido como datos de siembra para identificar el método de normalización utilizado en situaciones de desconocimiento o dudoso.

 GermOnline 4.0 is a genomics gateway for germline development, meiosis and the mitotic cell cycle.

100 BP DNA LADDER, 500UL PER KIT
M-DNA-100BP CORNING
1 KB DNA LADDER, 500UL PER KIT
M-DNA-1KB CORNING
DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-.1 ApexBio
DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-.25 ApexBio
DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-5 ApexBio

Base de datos e interfaces MAGIC: un paquete integrado para el descubrimiento y la expresión de genes.

El rápido aumento del ritmo de producción de datos biológicos exige un crecimiento correspondiente de las bases de datos relacionales y de las herramientas relacionadas que puedan ayudar a los laboratorios a competir con esos datos.

Teniendo en cuenta estas necesidades, describimos aquí la base de datos MAGIC (Genomic Approach Modular, Integrated and Comprehensive). La base de datos Oracle 9i o obtuvo a partir de un enfoque inicial en nuestro laboratorio sobre el descubrimiento de genes a través de la producción y el análisis de la etiqueta de secuencia expresada (EST), y luego la expresión de los genes que se consideran buenos mediante la agrupación de EST y microarrays.

Custom Antibody titration by ELISA up to 2 rabbits and 1 bleed
ELISA-1
Frit Kit
FRIT-KIT
Column Packing Kit
PACK-KIT

La parte de la base de datos de descubrimiento de genes MAGIC se centra en la información obtenida de la secuencia de ADN y su relevancia biológica. Además de MAGIC SEQ-LIMS, que está diseñado para apoyar las actividades en el laboratorio, contiene algunos subesquemas adicionales.

Custom Antibody titration by ELISA up to 2 rabbits and 1 bleed
Alpha Diagnostics
Frit Kit
Next Advance
Column Packing Kit
Next Advance

Trevor

Related Posts

fallback-image

Compare ELISA lab reagents for research

fallback-image

Compare recombinant lab reagents for research

fallback-image

polyclonal Lab Reagents for Research

fallback-image

MIAME/Plant – añadir valor a los experimentos de microarrays de plantas.

No Comment

Leave a Reply

Your email address will not be published.

Recent Posts

February 2023
M T W T F S S
 12345
6789101112
13141516171819
20212223242526
2728  

Categories

Tags

Pages